La Dirección de Investigación se aboca a desarrollar, promover y difundir la investigación, con el fin de contribuir al mejoramiento de la calidad de la educación que imparte la UISEK.  Sus acciones se encuentran en concordancia con el Plan Estratégico Institucional 2008-2012 y se desarrollan a través de siete Políticas de Investigación:

1.-Apoyar la formación de investigadores cuyos proyectos cumplan con los estándares establecidos en los concursos a fondos públicos del Estado. 

2.-Incentivar en los académicos la postulación a los fondos de investigación del Estado (Fondecyt, Fondef, Fonis, Explora, Conicyt, Corfo, Fondart, etc.).

3.-Apoyar el vínculo entre la investigación y la educación universitaria, con énfasis en las problemáticas epistémicas de cada Facultad.

4.-Fortalecer la figura del profesor-investigador a través de estudios de postgrado, como medio para formar recursos humanos altamente calificados.

5.-Fomentar el intercambio académico mediante la creación de medios de difusión y divulgación de los resultados de las investigaciones.

6.-Promover la formación de una comunidad investigativa al interior de la red de universidades SEK y otras instituciones, a través de la firma de convenios, alianzas y acuerdos que tiendan a la búsqueda de recursos externos.

7.-Impulsar la participación de los estudiantes en las actividades de investigación, a través de las líneas particulares de cada Facultad.

Con el fin de dar cumplimento a las Políticas de Investigación, la UISEK ha determinado crear fondos y mecanismos formales para su implementación, aplicación y difusión sistémica en directo beneficio de toda la comunidad universitaria.